Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms