Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP8Q9BV40 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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