Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX7

TTPAL, Alpha-tocopherol transfer protein-like, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPALQ9BTX7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPALQ9BTX7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms