Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERPUD2Q9BSE4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERPUD2Q9BSE4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HERPUD2Q9BSE4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERPUD2Q9BSE4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HERPUD2Q9BSE4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERPUD2Q9BSE4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERPUD2Q9BSE4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERPUD2Q9BSE4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERPUD2Q9BSE4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERPUD2Q9BSE4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERPUD2Q9BSE4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERPUD2Q9BSE4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERPUD2Q9BSE4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERPUD2Q9BSE4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERPUD2Q9BSE4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERPUD2Q9BSE4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERPUD2Q9BSE4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERPUD2Q9BSE4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERPUD2Q9BSE4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERPUD2Q9BSE4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERPUD2Q9BSE4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERPUD2Q9BSE4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERPUD2Q9BSE4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERPUD2Q9BSE4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD2Q9BSE4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms