Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms