Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms