Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms