Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RPS6KC1Q96S38 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms