Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED4Q96RK1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms