Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALS2Q96Q42 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms