Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
JSRP1Q96MG2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms