Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms