Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SAMD8Q96LT4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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