Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms