Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms