Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RNF185Q96GF1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms