Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms