Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CMTM5Q96DZ9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms