Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C18orf8Q96DM3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms