Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRUQ92729 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms