Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3BQ92485 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms