Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms