Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC4Q8TBB5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms