Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1Q8TAE8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1Q8TAE8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1Q8TAE8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1Q8TAE8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1Q8TAE8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1Q8TAE8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1Q8TAE8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1Q8TAE8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1Q8TAE8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1Q8TAE8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1Q8TAE8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1Q8TAE8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1Q8TAE8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1Q8TAE8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1Q8TAE8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1Q8TAE8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1Q8TAE8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1Q8TAE8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1Q8TAE8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1Q8TAE8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1Q8TAE8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1Q8TAE8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1Q8TAE8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1Q8TAE8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45GIP1Q8TAE8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms