Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms