Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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