Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNBD1Q8NA66 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms