Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms