Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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C9orf40Q8IXQ3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf40Q8IXQ3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C9orf40Q8IXQ3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C9orf40Q8IXQ3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C9orf40Q8IXQ3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
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C9orf40Q8IXQ3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C9orf40Q8IXQ3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf40Q8IXQ3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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C9orf40Q8IXQ3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf40Q8IXQ3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf40Q8IXQ3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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C9orf40Q8IXQ3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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C9orf40Q8IXQ3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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C9orf40Q8IXQ3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf40Q8IXQ3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf40Q8IXQ3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf40Q8IXQ3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf40Q8IXQ3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf40Q8IXQ3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf40Q8IXQ3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf40Q8IXQ3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf40Q8IXQ3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf40Q8IXQ3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf40Q8IXQ3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf40Q8IXQ3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf40Q8IXQ3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf40Q8IXQ3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf40Q8IXQ3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf40Q8IXQ3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf40Q8IXQ3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf40Q8IXQ3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf40Q8IXQ3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf40Q8IXQ3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf40Q8IXQ3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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