Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5D8

NANOGNB, NANOG neighbor homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGNBQ7Z5D8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGNBQ7Z5D8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms