Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE3BQ7Z3V4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3BQ7Z3V4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms