Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J2

C16orf62, UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62Q7Z3J2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf62Q7Z3J2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms