Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms