Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms