Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q71RC1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q71RC1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms