Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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