Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms