Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms