Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6Q795 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms