Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms