Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RCSD1Q6JBY9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms