Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYSMD4Q5XG99 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms