Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms