Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FRMPD1Q5SYB0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms