Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A3Q5K4L6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms