Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ODF2Q5BJF6 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms