Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC178Q5BJE1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms