Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms