Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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LAMA3Q16787 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAMA3Q16787 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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