Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FXNQ16595 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
FXNQ16595 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
FXNQ16595 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FXNQ16595 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FXNQ16595 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FXNQ16595 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FXNQ16595 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FXNQ16595 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FXNQ16595 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FXNQ16595 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FXNQ16595 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FXNQ16595 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FXNQ16595 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FXNQ16595 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FXNQ16595 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FXNQ16595 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FXNQ16595 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FXNQ16595 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FXNQ16595 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FXNQ16595 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FXNQ16595 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FXNQ16595 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FXNQ16595 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FXNQ16595 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FXNQ16595 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FXNQ16595 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FXNQ16595 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FXNQ16595 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FXNQ16595 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FXNQ16595 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FXNQ16595 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FXNQ16595 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FXNQ16595 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FXNQ16595 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FXNQ16595 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FXNQ16595 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FXNQ16595 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FXNQ16595 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FXNQ16595 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FXNQ16595 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FXNQ16595 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FXNQ16595 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FXNQ16595 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FXNQ16595 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FXNQ16595 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FXNQ16595 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FXNQ16595 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FXNQ16595 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FXNQ16595 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FXNQ16595 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FXNQ16595 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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FXNQ16595 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FXNQ16595 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FXNQ16595 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FXNQ16595 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FXNQ16595 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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FXNQ16595 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FXNQ16595 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FXNQ16595 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FXNQ16595 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FXNQ16595 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FXNQ16595 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FXNQ16595 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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FXNQ16595 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FXNQ16595 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FXNQ16595 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FXNQ16595 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FXNQ16595 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FXNQ16595 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FXNQ16595 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FXNQ16595 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FXNQ16595 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FXNQ16595 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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FXNQ16595 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
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FXNQ16595 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FXNQ16595 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FXNQ16595 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FXNQ16595 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FXNQ16595 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FXNQ16595 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FXNQ16595 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FXNQ16595 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FXNQ16595 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FXNQ16595 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FXNQ16595 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FXNQ16595 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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